More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02243 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  341  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  56.13 
 
 
166 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  48.05 
 
 
167 aa  156  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  45.16 
 
 
162 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  46.67 
 
 
154 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  45.81 
 
 
154 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
164 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
154 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  48.23 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  48.23 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.71 
 
 
188 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  46.98 
 
 
148 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  47.55 
 
 
150 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  50.86 
 
 
205 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
183 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  54.78 
 
 
156 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  42.26 
 
 
189 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  42.68 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  42.68 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  42.68 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  50 
 
 
196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  42.68 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  42.68 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  48.7 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  48.7 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  50.86 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  42.5 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  42.04 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.03 
 
 
154 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.68 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.04 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  42.04 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  42.04 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  49.57 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  42.04 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  43.28 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
171 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  43.62 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  49.57 
 
 
194 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  40.49 
 
 
162 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  49.57 
 
 
193 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 
191 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  42.14 
 
 
157 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  43.75 
 
 
154 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
154 aa  121  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
154 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  48.7 
 
 
194 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  43.75 
 
 
154 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  48.7 
 
 
194 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  48.7 
 
 
172 aa  120  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  35.5 
 
 
171 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  38.82 
 
 
154 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
155 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  43.38 
 
 
246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  50 
 
 
346 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
211 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  47.75 
 
 
246 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  37.97 
 
 
333 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  48.15 
 
 
341 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  48.62 
 
 
342 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
165 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  38.74 
 
 
201 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
240 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  36.5 
 
 
173 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
342 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
342 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  37.65 
 
 
176 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
265 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
347 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  36.93 
 
 
369 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
208 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  35.26 
 
 
354 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  45.05 
 
 
152 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  43.75 
 
 
170 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  35.26 
 
 
353 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  45.05 
 
 
153 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  32.8 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.44 
 
 
285 aa  98.2  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  36.02 
 
 
173 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
363 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  35.59 
 
 
363 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  35.59 
 
 
363 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>