185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02200 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  84.21 
 
 		 295 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  70.38 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  69.66 
 
 		 298 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  70.07 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  61.05 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  54.96 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.76 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  32.68 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  31.92 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  31.78 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  31.78 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  31.91 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  28.9 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  31.4 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.3 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.51 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  30.59 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.34 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.34 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  31.5 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  24.75 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  28.74 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.37 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.38 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  26.52 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  26.52 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  28.74 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  28.08 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  24.52 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  29.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  29.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  29.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  29.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  28.57 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.57 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  25 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  28.68 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  28.85 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  27.62 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  25.52 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  22.81 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.62 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  25.77 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.96 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  23.13 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.4 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  24.34 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.96 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  24.33 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.29 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  23.4 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  23.08 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  23.66 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  26.26 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  22.18 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.24 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.09 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  24.58 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  24.52 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  24.18 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>