More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02180 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  78.28 
 
 		 222 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  59.91 
 
 		 215 aa  264  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  59.28 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  58.82 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  55.09 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  54.67 
 
 		 221 aa  244  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  57.47 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  57.47 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  57.27 
 
 		 216 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  54.46 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  53.39 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  55.25 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  56.11 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  54.75 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  56.11 
 
 		 216 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  56.11 
 
 		 216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  54.75 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  55.2 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  53.39 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  54.13 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  49.32 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  47.22 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  47.22 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  48.61 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  47.69 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  49.32 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  47.69 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  47.69 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  49.53 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  48.15 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  48.15 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  47.22 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  46.79 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 214 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  48.61 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  47.69 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  48.15 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  46.08 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  45.15 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  43.52 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  43.26 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  47.17 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  44.29 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.52 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  47.09 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  43.06 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0920  maleylacetoacetate isomerase  42.47 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  45.37 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  39.81 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  41.2 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  42.59 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  42.79 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  41.86 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  44.04 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  42.2 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  42.59 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  42.59 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  41.1 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  41.82 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  41.4 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  42.38 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  43.05 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  44.29 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  40.28 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  42.29 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  42.13 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  42.13 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  42.13 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  42.08 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  41.63 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>