More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02174 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  92.92 
 
 		 368 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  100 
 
 		 368 aa  747    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  78.18 
 
 		 368 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  71.31 
 
 		 391 aa  541  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  69.29 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  67.66 
 
 		 381 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  50.14 
 
 		 372 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  43.01 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  45.18 
 
 		 375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  45.6 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  42.78 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  44.32 
 
 		 368 aa  288  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  43.58 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  45.35 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  41.53 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  44.48 
 
 		 372 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  43.96 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  42.54 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  43.92 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  42.58 
 
 		 368 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  43.96 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  42.08 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  39.84 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  39.13 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  40.6 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  38.54 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  39.84 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  38.4 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  37.99 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  37.99 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  38.52 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  40 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  37.96 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  32.79 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  34.84 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  33.23 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  29.95 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  29.8 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.89 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  26.6 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  31.07 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  25.78 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  24.55 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  25.14 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  26.81 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  27.2 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  30.11 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  28.83 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.47 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  26.25 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.68 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  27.54 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  25.6 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  25.25 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.91 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  23.77 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  25.99 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  25.69 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  25.6 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  24.52 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  23.6 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  23.6 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  23.6 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  23.8 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  26.37 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.47 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  24.59 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  25.93 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  26.51 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  25.93 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.76 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.56 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  25.74 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  26.05 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  25.3 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  28.03 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  25.36 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  25.36 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  25.12 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  26.29 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  22.96 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  25.14 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  25.66 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  24.65 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  26.97 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  25.06 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  25.12 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  25.06 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  25.5 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  25.06 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  25.06 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>