247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02130 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  89.8 
 
 
598 aa  1135    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  59.66 
 
 
593 aa  747    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  100 
 
 
599 aa  1247    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.77 
 
 
612 aa  346  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.81 
 
 
598 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  30.68 
 
 
607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  31 
 
 
603 aa  298  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  29.93 
 
 
593 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.05 
 
 
586 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  31.19 
 
 
600 aa  280  6e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  30.54 
 
 
597 aa  267  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.55 
 
 
582 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.39 
 
 
603 aa  251  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.54 
 
 
603 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.55 
 
 
593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.39 
 
 
606 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.27 
 
 
584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  30.75 
 
 
587 aa  219  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  28.6 
 
 
527 aa  207  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  28.64 
 
 
529 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  27.6 
 
 
527 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  28.28 
 
 
527 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  28.05 
 
 
527 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  28.51 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.65 
 
 
607 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.23 
 
 
622 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.77 
 
 
539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  27.83 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.08 
 
 
614 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
620 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 
620 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.56 
 
 
607 aa  194  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.7 
 
 
620 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.66 
 
 
620 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  28.94 
 
 
394 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.85 
 
 
617 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  26.19 
 
 
619 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.83 
 
 
625 aa  188  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  26.67 
 
 
596 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.75 
 
 
612 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  25.21 
 
 
664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.16 
 
 
626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.61 
 
 
615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  24.96 
 
 
626 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.29 
 
 
608 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.15 
 
 
627 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.73 
 
 
617 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.1 
 
 
615 aa  179  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.19 
 
 
625 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.1 
 
 
625 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.87 
 
 
620 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.57 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.71 
 
 
616 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.36 
 
 
616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.24 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26 
 
 
606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  24.79 
 
 
610 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  24.72 
 
 
632 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  25.83 
 
 
606 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.54 
 
 
601 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.67 
 
 
606 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  25.58 
 
 
611 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.5 
 
 
589 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.81 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  24.71 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.57 
 
 
623 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.5 
 
 
634 aa  164  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.62 
 
 
616 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.58 
 
 
588 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.4 
 
 
588 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.19 
 
 
592 aa  160  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.83 
 
 
573 aa  156  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.83 
 
 
590 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.64 
 
 
638 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  26.34 
 
 
573 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  25.33 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  26.34 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  24.01 
 
 
598 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.01 
 
 
598 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.45 
 
 
603 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.44 
 
 
589 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  25.68 
 
 
571 aa  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  26.03 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  26.09 
 
 
569 aa  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.53 
 
 
584 aa  140  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  24.89 
 
 
573 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.49 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  23.09 
 
 
566 aa  134  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  25.81 
 
 
572 aa  133  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  24.86 
 
 
608 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0130  oligoendopeptidase F  24.6 
 
 
604 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000121565  hitchhiker  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  22.62 
 
 
600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  23.44 
 
 
602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  23.44 
 
 
602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1445  oligoendopeptidase F  23.26 
 
 
604 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.898527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1474  oligoendopeptidase F  23.26 
 
 
604 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0757651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  24.37 
 
 
607 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  23.47 
 
 
596 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  20.83 
 
 
597 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 
600 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>