160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02107 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  55.29 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  48.84 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  49.01 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  48.68 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  51.34 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  33.11 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.75 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  32.46 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  32.46 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  33.76 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  31.76 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  31.53 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  30.88 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  28.14 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  32.31 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  30.04 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  34.51 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  30.95 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  27.67 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  29.41 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  28.67 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  30.14 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  26.6 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  29.66 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  26.6 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  26.6 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  30.28 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  24.58 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.41 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  30.8 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  25.44 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  29.51 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  25.44 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  33.08 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  29.25 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  29.25 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  27.17 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.68 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  28.03 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  28.03 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  25.89 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  26.25 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  26.34 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  27.64 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  25.42 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  29.74 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  29.93 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.33 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.85 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.43 
 
 		 694 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  21.86 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  24.92 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  24.5 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.69 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  24.91 
 
 		 655 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.09 
 
 		 658 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.55 
 
 		 653 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  23.75 
 
 		 655 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0022  ferrichrome ABC transporter  24.13 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.595874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  23.62 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  25.58 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.67 
 
 		 662 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  24.83 
 
 		 358 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  26.12 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.57 
 
 		 696 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  26.12 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  26.12 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  27.12 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.42 
 
 		 702 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.34 
 
 		 672 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.25 
 
 		 696 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  23.25 
 
 		 696 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.27 
 
 		 704 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.51 
 
 		 696 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  23.33 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  23.33 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  23.33 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  23.33 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  23.33 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  23.81 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  22.95 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  20.68 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  22.88 
 
 		 697 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>