299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02097 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  52.12 
 
 
293 aa  299  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  44.65 
 
 
296 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  41.67 
 
 
285 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.07 
 
 
319 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  40.38 
 
 
287 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  44.02 
 
 
294 aa  221  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  44.57 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  41.73 
 
 
284 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  41.8 
 
 
297 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  39.02 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  42.91 
 
 
284 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  42.35 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  41.88 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  42.35 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  41.8 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  41.86 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  40.23 
 
 
297 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  40.55 
 
 
295 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  40.55 
 
 
295 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  40.55 
 
 
295 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  40.55 
 
 
295 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  40.23 
 
 
297 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  39.84 
 
 
297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  40.71 
 
 
295 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  40.71 
 
 
295 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  42.29 
 
 
291 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  40.94 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  41.34 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  41.34 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  41.34 
 
 
285 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  42.69 
 
 
291 aa  204  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  40.55 
 
 
285 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  41.34 
 
 
291 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  41.8 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  41.73 
 
 
290 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  41.73 
 
 
283 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  48.6 
 
 
207 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  41.2 
 
 
270 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  40.15 
 
 
299 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  43.59 
 
 
221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  44.57 
 
 
212 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  42.94 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  39.41 
 
 
220 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  45.6 
 
 
207 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  45.83 
 
 
251 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  41.99 
 
 
221 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  37.99 
 
 
211 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  38.76 
 
 
218 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  41.81 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  39.34 
 
 
207 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  39.34 
 
 
207 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  39.01 
 
 
207 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  39.01 
 
 
207 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  38.86 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  33.69 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.43 
 
 
195 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  26.28 
 
 
191 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  41.18 
 
 
179 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  38.82 
 
 
179 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
209 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  40 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.48 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 
191 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  38.82 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  38.82 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  38.82 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  38.82 
 
 
179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  37.65 
 
 
179 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  38.82 
 
 
179 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 
184 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
179 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
185 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  38.36 
 
 
2174 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  29.51 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>