More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02060 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  437  1e-122  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  94.98 
 
 
222 aa  355  4e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  78.9 
 
 
223 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  74.89 
 
 
222 aa  307  1e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  56.34 
 
 
215 aa  188  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  49.05 
 
 
225 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  45.33 
 
 
223 aa  161  8e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.64342e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  45.87 
 
 
225 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  48.57 
 
 
219 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.05 
 
 
231 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  43.38 
 
 
215 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  44.23 
 
 
241 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  46.51 
 
 
230 aa  152  3e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.6276e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  46.51 
 
 
230 aa  152  3e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.40918e-08  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  46.51 
 
 
230 aa  152  3e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  46.51 
 
 
230 aa  152  3e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  49.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  49.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  49.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  49.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  49.76 
 
 
220 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  49.05 
 
 
219 aa  146  2e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  47.87 
 
 
220 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
219 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 
224 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  46.94 
 
 
225 aa  140  2e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.6 
 
 
215 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  49.37 
 
 
224 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  46.7 
 
 
224 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  49.3 
 
 
236 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.25 
 
 
205 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  47.85 
 
 
221 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  46.08 
 
 
243 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  48.61 
 
 
220 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  46.08 
 
 
220 aa  135  6e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  50.93 
 
 
224 aa  135  6e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  9.08263e-07  unclonable  1.27118e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  46.98 
 
 
218 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
218 aa  132  4e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  48.59 
 
 
222 aa  132  4e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.63 
 
 
218 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.98 
 
 
223 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 
228 aa  130  1e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  46.05 
 
 
228 aa  130  1e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  45.86 
 
 
233 aa  130  1e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  6.20554e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  42.72 
 
 
222 aa  130  2e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
230 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.45 
 
 
226 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.54 
 
 
228 aa  128  5e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.54 
 
 
228 aa  128  5e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 
230 aa  129  5e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.15803e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  44.7 
 
 
221 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 
230 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.80741e-07  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 
224 aa  128  7e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 
230 aa  128  7e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.5492e-07  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  50.31 
 
 
226 aa  127  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  49.08 
 
 
222 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 
224 aa  124  8e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  49.38 
 
 
237 aa  124  8e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  45.41 
 
 
221 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.94 
 
 
233 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  46.48 
 
 
219 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  46.48 
 
 
219 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  46.48 
 
 
219 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  46.91 
 
 
228 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.89 
 
 
241 aa  120  1e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.89 
 
 
241 aa  120  1e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.76 
 
 
230 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 
236 aa  119  4e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 
209 aa  119  4e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.4 
 
 
229 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.01 
 
 
229 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 
222 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  44.06 
 
 
230 aa  114  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 
218 aa  114  1e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  42.79 
 
 
221 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  43.83 
 
 
221 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  40 
 
 
221 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  44.68 
 
 
217 aa  111  8e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.15 
 
 
215 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
182 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 
240 aa  110  1e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  44.6 
 
 
237 aa  111  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  44.6 
 
 
237 aa  111  1e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  48.41 
 
 
229 aa  111  1e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 
221 aa  110  2e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 
205 aa  110  2e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  37.79 
 
 
229 aa  110  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 
227 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 
240 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  43.17 
 
 
222 aa  109  4e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.73 
 
 
236 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 
247 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  43.17 
 
 
229 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
227 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>