38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01960 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  37.74 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  47.95 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  47.95 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  37.1 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1691  hypothetical protein  34.21 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  41 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  43.24 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  43.28 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  31.06 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3327  hypothetical protein  38.24 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  39.44 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  38.67 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  29.41 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  42.67 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2872  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1032  gp69  47.17 
 
 		 86 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1318  hypothetical protein  29.58 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3366  putative replication protein  33.8 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  28.07 
 
 		 197 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3257  putative replication protein  33.8 
 
 		 278 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.699419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  33.8 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  33.8 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2025  hypothetical protein  34.94 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214118  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3123  hypothetical protein  32.89 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00465086  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  32.93 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2558  putative replication protein  33.8 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6266  hypothetical protein  32.88 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  36.11 
 
 		 86 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0383  hypothetical protein  29.87 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.455969  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  40.82 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  40.82 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4654  hypothetical protein  41.82 
 
 		 392 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467164  normal  0.232451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>