162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01954 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  61.54 
 
 		 221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  61.09 
 
 		 229 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  50.47 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  49.52 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  49.52 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  44.1 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  44.1 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  40.91 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  40.45 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  40.91 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  37.9 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  37.44 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  38.57 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  39.91 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  36.24 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  35.59 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  32.42 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  46.51 
 
 		 133 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  34.25 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  30.36 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  32.87 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  32.23 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  31.22 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  32.56 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  29.86 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.57 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.66 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  40.46 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  41.56 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  30.18 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.4 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.53 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  35.04 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.54 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  23.11 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  27.75 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  24.55 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  28.88 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.95 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  26.01 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  24.09 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  31.87 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.21 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  35.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  25.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  35.16 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.07 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  25.73 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.93 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  33.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  33.59 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.41 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.46 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  31.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  31.85 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.37 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  31.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  31.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  36.8 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  31.16 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  31.16 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  31.16 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  31.16 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  22.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  31.16 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  31.16 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  24.8 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.21 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.93 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  24.5 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  38.1 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  32.54 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  29.23 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.08 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  28.43 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  28.79 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  30.95 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  30.95 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  31.13 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1781  putative prophage repressor  28.57 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  32.35 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  32.35 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>