136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01854 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  527  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  82.24 
 
 
270 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  58.17 
 
 
263 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  58.04 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  60.08 
 
 
263 aa  291  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  54.65 
 
 
271 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  53.21 
 
 
270 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  38.17 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  37.26 
 
 
263 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  38.82 
 
 
265 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1858  putative ABC transport system permease protein  36.02 
 
 
264 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0986378  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3073  hypothetical protein  40 
 
 
264 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  36.68 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  31.08 
 
 
263 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  33.46 
 
 
267 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  40.2 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  32.44 
 
 
264 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  32.68 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  34.5 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  34.5 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  35.64 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  33.5 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  35.89 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  34.85 
 
 
260 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  37.93 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  33.6 
 
 
265 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  30.86 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  33.59 
 
 
262 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  33.59 
 
 
262 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  37.5 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  30.11 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  33.2 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  33.2 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  29.96 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  37.82 
 
 
264 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  33.07 
 
 
264 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  36.32 
 
 
266 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  34.3 
 
 
251 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  36.71 
 
 
263 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  31.67 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  29.46 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  33.74 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  31.49 
 
 
269 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  31.05 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.74 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  29.67 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  35.71 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  31.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  31.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  31.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  31.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  31.2 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  31.4 
 
 
258 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  30.23 
 
 
257 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  33.82 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  30.99 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  29.58 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  30.26 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  28.51 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  31.55 
 
 
267 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  39.42 
 
 
266 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  30.09 
 
 
267 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  35.07 
 
 
268 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  30.7 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  30.7 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  28.69 
 
 
259 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  31.51 
 
 
260 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  31.55 
 
 
267 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  29.33 
 
 
267 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  27.64 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  28.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  35.47 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  28.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  28.89 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  34 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.23 
 
 
251 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  35.77 
 
 
261 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  29.57 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  29.05 
 
 
272 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  30.54 
 
 
263 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  29.58 
 
 
259 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  29.58 
 
 
259 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  29.57 
 
 
269 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>