57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01814 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01814  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  289  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003865  putative transcriptional regulator  91.37 
 
 
139 aa  267  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0636  putative transcriptional regulator  61.15 
 
 
142 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0812  transcriptional regulator-related protein  49.64 
 
 
167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1381  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  48.18 
 
 
143 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1480  hypothetical protein  47.41 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1483  hypothetical protein  44.12 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  46.56 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3053  transcriptional regulator-related protein  46.56 
 
 
148 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1310  transcriptional regulator-related protein  46.56 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3067  transcriptional regulator-related protein  47.33 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3210  transcriptional regulator-related protein  46.56 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0999  transcriptional regulator  45.26 
 
 
141 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.859219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3035  hypothetical protein  47.79 
 
 
167 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.21304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  46.72 
 
 
140 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1237  transcriptional regulator-related protein  45.8 
 
 
148 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1167  transcriptional regulator-related protein  45.8 
 
 
148 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2776  hypothetical protein  43.28 
 
 
143 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.857433  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1166  transcriptional regulator-related protein  47.73 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1330  hypothetical protein  41.22 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.522262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0464  hypothetical protein  37.04 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3383  transcriptional regulator-related protein  44.27 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  42.34 
 
 
140 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0960  hypothetical protein  45.8 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2096  hypothetical protein  41.67 
 
 
159 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.364867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1120  hypothetical protein  45.04 
 
 
140 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3015  hypothetical protein  40.58 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2100  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2738  hypothetical protein  40.58 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2470  ketosteroid isomerase-related protein, cystatin fold  37.59 
 
 
147 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.4042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3171  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0218513  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1491  hypothetical protein  37.04 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1179  hypothetical protein  32.33 
 
 
144 aa  93.2  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4074  hypothetical protein  33.58 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 
159 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01435  hypothetical protein  33.78 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0469  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2390  hypothetical protein  29.01 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0229  hypothetical protein  31.3 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2963  hypothetical protein  28.36 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5879  hypothetical protein  27.82 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1456  hypothetical protein  28.68 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1399  hypothetical protein  24.09 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0497  hypothetical protein  28.78 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.445375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18511  transcription regulator  30.77 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1888  hypothetical protein  28.68 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18321  transcription regulator  31.62 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1046  transcriptional regulator  31.67 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1734  transcription regulator-like  29.91 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24686  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0784  transcription regulator  29.17 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16341  hypothetical protein  28.33 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.832148  normal  0.369821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  27.35 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0949  transcriptional regulator  28.33 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  26.67 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0728  hypothetical protein  24.62 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  24.41 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>