More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01764 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  100 
 
 		 327 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  35.97 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.94 
 
 		 678 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.01 
 
 		 678 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.01 
 
 		 678 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.94 
 
 		 678 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.85 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.01 
 
 		 678 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.94 
 
 		 678 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.65 
 
 		 678 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  33.04 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  33.04 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  33.04 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.74 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.33 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2124  transport system permease protein  39.22 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105948  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.8 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.85 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.8 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.8 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  37.63 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  36.3 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  36.3 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  36.3 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  32.49 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.14 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  32.49 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  34.77 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  34.77 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  36.48 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  36.71 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  42.96 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  33.98 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  36.71 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  33.98 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  36.04 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  36.01 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.22 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  37.12 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  40.7 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  36.72 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  40.7 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  40.7 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  40.7 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  40.7 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  38.71 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  34.36 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  34.36 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  34.36 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.68 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  31.14 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.93 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  35 
 
 		 376 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  31.41 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  34.83 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  31.41 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  37.63 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  37.06 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.64 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.64 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  29.91 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  35.41 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.33 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.39 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.96 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.78 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  34.95 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55020  ABC transporter permease  36.66 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520713  unclonable  2.14331e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35.42 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  35.24 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  31.12 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.29 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  31.42 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  34.41 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.4 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>