More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01723 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  88.51 
 
 
351 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  100 
 
 
349 aa  709    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  62.17 
 
 
354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  62.97 
 
 
349 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  43.86 
 
 
346 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  43.8 
 
 
346 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.44 
 
 
356 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  35.69 
 
 
349 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  35.41 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  36.49 
 
 
355 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  35.76 
 
 
345 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  36.21 
 
 
355 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  35.92 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.5 
 
 
354 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.39 
 
 
360 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  35.98 
 
 
359 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  36 
 
 
360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.59 
 
 
354 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.96 
 
 
381 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.19 
 
 
392 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
378 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.9 
 
 
363 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.59 
 
 
355 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  34.86 
 
 
352 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  34.93 
 
 
352 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  34.93 
 
 
352 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  35.21 
 
 
352 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  34.93 
 
 
352 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.39 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.85 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.52 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  34.86 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.69 
 
 
353 aa  199  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.82 
 
 
357 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.82 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.88 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.82 
 
 
361 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
357 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  35.71 
 
 
359 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  33.33 
 
 
352 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.17 
 
 
403 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
382 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.17 
 
 
406 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.76 
 
 
376 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.7 
 
 
376 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 
390 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
362 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
382 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 
368 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  35.43 
 
 
352 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.4 
 
 
360 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  35.43 
 
 
352 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.9 
 
 
363 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.86 
 
 
374 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.33 
 
 
376 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.82 
 
 
381 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.19 
 
 
360 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.05 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.14 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.77 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.57 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  32.95 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.77 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.77 
 
 
383 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  35.14 
 
 
359 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  35.96 
 
 
352 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.77 
 
 
383 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  35.96 
 
 
352 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  35.96 
 
 
352 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.28 
 
 
359 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.64 
 
 
377 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
411 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.71 
 
 
376 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.58 
 
 
382 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
358 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 
376 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
398 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
376 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  34 
 
 
350 aa  186  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.05 
 
 
376 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.75 
 
 
405 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
401 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1171  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.17 
 
 
383 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127204 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
401 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
401 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.28 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.81 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.52 
 
 
376 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.75 
 
 
363 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.24 
 
 
358 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  33.43 
 
 
381 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.83 
 
 
366 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.62 
 
 
376 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.57 
 
 
378 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.04 
 
 
405 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>