More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01627 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  100 
 
 
290 aa  601  1e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  47.33 
 
 
412 aa  254  1e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  44.93 
 
 
411 aa  253  2e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  43.45 
 
 
422 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  45.39 
 
 
411 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  44.68 
 
 
411 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  45.02 
 
 
411 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  43.37 
 
 
413 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  43.96 
 
 
409 aa  248  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  43.02 
 
 
415 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  42.7 
 
 
418 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  42.7 
 
 
415 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  43.01 
 
 
414 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  44.79 
 
 
408 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  40.93 
 
 
418 aa  239  3e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  40.57 
 
 
419 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  39.58 
 
 
418 aa  232  7e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  40.07 
 
 
416 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  39.72 
 
 
413 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  39.36 
 
 
417 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  41.11 
 
 
410 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  40.08 
 
 
397 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  40.23 
 
 
395 aa  222  5e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  37.63 
 
 
410 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  38.65 
 
 
414 aa  218  8e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  39.46 
 
 
398 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  38.3 
 
 
415 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  39.07 
 
 
413 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  37.93 
 
 
403 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  37.23 
 
 
413 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  38.3 
 
 
408 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  37.74 
 
 
402 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  36.7 
 
 
416 aa  199  4e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  35.96 
 
 
416 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  36.19 
 
 
399 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  35.88 
 
 
416 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  34.18 
 
 
409 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  35.58 
 
 
413 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  35.4 
 
 
423 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  34.31 
 
 
409 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  34.31 
 
 
409 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  34.31 
 
 
436 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  32.73 
 
 
418 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  33.21 
 
 
413 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  31.1 
 
 
448 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  31.02 
 
 
404 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  29.04 
 
 
402 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  29.93 
 
 
404 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.71 
 
 
391 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  30.8 
 
 
404 aa  155  5e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  28.84 
 
 
401 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.68 
 
 
404 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.68 
 
 
404 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.68 
 
 
404 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  32.97 
 
 
412 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.88 
 
 
402 aa  152  9e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.07 
 
 
394 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  30.53 
 
 
417 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.62 
 
 
404 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  30.53 
 
 
394 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  28.85 
 
 
389 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  30.53 
 
 
394 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  29.59 
 
 
396 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  29.53 
 
 
387 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.59 
 
 
394 aa  147  2e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.59 
 
 
394 aa  147  2e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  28.73 
 
 
395 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.1 
 
 
404 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  29.57 
 
 
410 aa  146  4e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  28.85 
 
 
396 aa  146  4e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  30.69 
 
 
423 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  30.47 
 
 
387 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  30.23 
 
 
417 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  29.6 
 
 
423 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  30.33 
 
 
420 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  8.85987e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  30.43 
 
 
418 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  30.11 
 
 
394 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 
397 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.52 
 
 
397 aa  141  1e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.67 
 
 
409 aa  141  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  29.96 
 
 
396 aa  141  1e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  28.68 
 
 
402 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.48 
 
 
396 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  32.85 
 
 
406 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  30.4 
 
 
407 aa  136  3e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  31.49 
 
 
419 aa  136  3e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  29.82 
 
 
401 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  29.53 
 
 
403 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.67 
 
 
406 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 
387 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  28.24 
 
 
440 aa  134  1e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  26.84 
 
 
418 aa  134  2e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  26.47 
 
 
419 aa  134  2e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  29.41 
 
 
412 aa  134  2e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  28.35 
 
 
391 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  29.96 
 
 
419 aa  133  4e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  27.54 
 
 
419 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  27.9 
 
 
419 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  26.45 
 
 
421 aa  132  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  28.36 
 
 
402 aa  131  1e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>