43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01520 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  961    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  87.96 
 
 		 465 aa  845    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  61.71 
 
 		 472 aa  548  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  53.59 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  34.43 
 
 		 483 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 455 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 467 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 466 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  30.99 
 
 		 459 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  29.66 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  23.67 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  25.84 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  23.65 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  23.27 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  24.02 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  23.87 
 
 		 509 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  23.67 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  21.39 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  23.87 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  23.58 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.43 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  23.78 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  21.26 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  23.71 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  23.92 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  24.07 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  21.93 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  23.02 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  20.21 
 
 		 534 aa  50.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  21.72 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>