More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01343 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  83.14 
 
 
255 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  67.98 
 
 
257 aa  362  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  53.41 
 
 
258 aa  284  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  48.54 
 
 
257 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  47.6 
 
 
259 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  48.05 
 
 
259 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  49.59 
 
 
257 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  47.7 
 
 
254 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  47.7 
 
 
254 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  47.7 
 
 
254 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  47.7 
 
 
254 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  47.7 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  48.32 
 
 
256 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  47.28 
 
 
254 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  47.9 
 
 
256 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  47.9 
 
 
256 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  47.9 
 
 
256 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  47.9 
 
 
256 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  46.86 
 
 
254 aa  235  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  46.03 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  46.86 
 
 
254 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  46.03 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  44.92 
 
 
260 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  45.63 
 
 
255 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  46.44 
 
 
254 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  44.17 
 
 
311 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  43.97 
 
 
260 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  44.02 
 
 
260 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  42.02 
 
 
265 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 
259 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
252 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
257 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
258 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  38.82 
 
 
280 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
258 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
255 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  39.3 
 
 
262 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
266 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  39.5 
 
 
258 aa  184  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
266 aa  184  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
255 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
258 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  38.58 
 
 
258 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
264 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 
268 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
254 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  42.41 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
253 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 
271 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  38.46 
 
 
253 aa  161  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
256 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  36.9 
 
 
256 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 
267 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 
255 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
261 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
252 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  37.05 
 
 
259 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
253 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  37.45 
 
 
256 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
264 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
258 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
264 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
264 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
257 aa  148  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
226 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  34.32 
 
 
235 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  33.6 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
281 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
268 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  33.6 
 
 
295 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.64 
 
 
264 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
260 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.32 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  31.27 
 
 
293 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  29.85 
 
 
356 aa  102  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  27.2 
 
 
261 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  28.02 
 
 
306 aa  89.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.66 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  26.56 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.95 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>