130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01322 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  100 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  89.5 
 
 		 181 aa  346  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  65.75 
 
 		 189 aa  241  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  64.97 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  61.58 
 
 		 183 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  60.22 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  58.24 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  58.82 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  56.04 
 
 		 183 aa  208  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  54.95 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  54.95 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  54.95 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  55.49 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  57.14 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  54.95 
 
 		 183 aa  200  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  51.1 
 
 		 184 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  51.1 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  47.31 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  51.93 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  43.09 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  48.35 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.44 
 
 		 182 aa  150  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  45.51 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  44.91 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  42.44 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.11 
 
 		 186 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  34.57 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  34.41 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.74 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  33.15 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.09 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  36.09 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  34.03 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  37.18 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.56 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.98 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.25 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  26.67 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.79 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.99 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  36 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.7 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.13 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  24.08 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  24.08 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.23 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  23.56 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  23.56 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  23.56 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  25.13 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  23.56 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.38 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.41 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.91 
 
 		 232 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.91 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  23.56 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  35.71 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.62 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.09 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  22.45 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.23 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  24.74 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.34 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  23.04 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  22.28 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  29.68 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  21.94 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.92 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.38 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  22.51 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  23.53 
 
 		 259 aa  48.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  25.89 
 
 		 293 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.14 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.54 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.77 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  31.4 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.94 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.46 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.6 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  24.63 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  29.37 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  29.37 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.14 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>