More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01273 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  650  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  85.05 
 
 
320 aa  534  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  59.01 
 
 
321 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.85 
 
 
330 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  41.82 
 
 
326 aa  233  2e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.75354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  41.03 
 
 
334 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  41.34 
 
 
321 aa  214  1e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.4 
 
 
367 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  32.61 
 
 
342 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  31.64 
 
 
333 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  31.92 
 
 
353 aa  141  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.8038e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  31.92 
 
 
357 aa  141  1e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  31.92 
 
 
353 aa  141  1e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  31.09 
 
 
356 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  31.21 
 
 
351 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.45833e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  32.04 
 
 
355 aa  135  7e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.17 
 
 
346 aa  134  2e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.93272e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  32.17 
 
 
354 aa  134  2e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.16879e-08  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  32.17 
 
 
365 aa  134  2e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.98773e-08  unclonable  2.77772e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  32.17 
 
 
346 aa  134  2e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  32.17 
 
 
346 aa  134  2e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.88885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  32.17 
 
 
346 aa  134  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  32.17 
 
 
346 aa  134  2e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.35 
 
 
355 aa  132  8e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  3.42607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.5 
 
 
350 aa  130  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  31.5 
 
 
358 aa  130  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  30.86 
 
 
358 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  30.86 
 
 
358 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  30.68 
 
 
371 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.86695e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  30.86 
 
 
369 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.33703e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  30.86 
 
 
369 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  30.72 
 
 
354 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.18487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  30.92 
 
 
358 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 
331 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  29.21 
 
 
361 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.65079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 
367 aa  122  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 
369 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.33 
 
 
369 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  27.3 
 
 
368 aa  115  8e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  29.53 
 
 
366 aa  115  1e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.16 
 
 
369 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  29.21 
 
 
355 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.58717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.32 
 
 
363 aa  112  7e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.83072e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.62 
 
 
376 aa  112  1e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  5.38127e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.32 
 
 
369 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  30 
 
 
319 aa  111  2e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  4.79334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  29.63 
 
 
319 aa  111  2e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  25.14 
 
 
372 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  26.63 
 
 
367 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 
219 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  47.17 
 
 
220 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  49.52 
 
 
219 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  47.17 
 
 
220 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  47.17 
 
 
220 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  47.17 
 
 
220 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  47.17 
 
 
220 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  25.63 
 
 
366 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.41 
 
 
372 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.63 
 
 
324 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  29.63 
 
 
319 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 
224 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  24.51 
 
 
373 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 
220 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  25.28 
 
 
370 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 
365 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.37 
 
 
226 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
214 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  6.45517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  52.53 
 
 
456 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.08 
 
 
230 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  47 
 
 
215 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  25.79 
 
 
468 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.80584e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.21 
 
 
227 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  31.42 
 
 
328 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  49.02 
 
 
415 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  47 
 
 
316 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  46.23 
 
 
220 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 
219 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  47 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  42.59 
 
 
214 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 
227 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
215 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  4.22184e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  44 
 
 
215 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
215 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
296 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.42 
 
 
377 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  27.7 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 
242 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  46.53 
 
 
228 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>