201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01207 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  95 
 
 		 205 aa  361  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  82.32 
 
 		 198 aa  310  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  74.75 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  47.42 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  43.72 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  47.94 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  47.67 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  45.6 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  45.88 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  45.88 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  44.56 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  47.94 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  46.88 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  47.42 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  43.08 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  43.08 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  45.36 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  45.64 
 
 		 257 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  46.15 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.35 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  45.13 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  41.97 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  43.3 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  44.04 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  43.23 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  38.14 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  44.56 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  41.45 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  39.8 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  43.75 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  41.54 
 
 		 209 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  36.98 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  37.11 
 
 		 228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  36.79 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  37.06 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  43.98 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  41.15 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  39.9 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  38.02 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  35.6 
 
 		 238 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  40.1 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  39.69 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  34.2 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  34.72 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  38.02 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  38.25 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  33.89 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  51.55 
 
 		 109 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  38.36 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  31.85 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  26.88 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  32.61 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.26 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  26.88 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  35.81 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  29.29 
 
 		 296 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  28.57 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  30.67 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  30.41 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  30.67 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  32.45 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  31.2 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  31.74 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  28.66 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.51 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  26.38 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  28.66 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  24.61 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2267  protein of unknown function DUF161  35.54 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  25.96 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  28.8 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  23.63 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.3 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0743  hypothetical protein  26.44 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108912  hitchhiker  0.0000688961 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  26.55 
 
 		 281 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  31.41 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2543  hypothetical protein  33.77 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  26.01 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  28 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3566  protein of unknown function DUF161  29.7 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332576  normal  0.685125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  28.08 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  28.08 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  27.84 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  32.91 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  29.71 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27.67 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>