278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01111 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1615    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  50.26 
 
 		 796 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  44.15 
 
 		 784 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  43.83 
 
 		 809 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  43.83 
 
 		 809 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  40.91 
 
 		 813 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  40.91 
 
 		 813 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  42.01 
 
 		 788 aa  618  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  41.05 
 
 		 795 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  43.8 
 
 		 768 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  42.95 
 
 		 786 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  43.34 
 
 		 796 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  42.19 
 
 		 799 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  43.36 
 
 		 785 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  41.39 
 
 		 794 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  42.02 
 
 		 815 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  40.83 
 
 		 971 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  40.45 
 
 		 925 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  37.48 
 
 		 998 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  30.22 
 
 		 920 aa  356  7.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.16 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 479 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 479 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.63 
 
 		 463 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.7 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.48 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.6 
 
 		 485 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 485 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  46.81 
 
 		 154 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  51.38 
 
 		 195 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.14 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.11 
 
 		 773 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  53.75 
 
 		 279 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.5 
 
 		 650 aa  94.7  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  23.78 
 
 		 473 aa  90.9  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.48 
 
 		 451 aa  91.3  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 654 aa  90.9  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 		 647 aa  89.7  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.08 
 
 		 967 aa  87.8  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 551 aa  87.4  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  25.8 
 
 		 1051 aa  87.4  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  32.09 
 
 		 451 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 652 aa  82  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25.74 
 
 		 643 aa  81.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.34 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.93 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.22 
 
 		 531 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  31.55 
 
 		 451 aa  80.5  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  33.93 
 
 		 551 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  25.3 
 
 		 1063 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  32.35 
 
 		 456 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  24.18 
 
 		 581 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  24.06 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  33.13 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.14 
 
 		 815 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  24.76 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.3 
 
 		 812 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  32.14 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.13 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.14 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.56 
 
 		 949 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  32.12 
 
 		 649 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  35.95 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.84 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  34.34 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  25.08 
 
 		 1053 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.77 
 
 		 974 aa  75.5  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.14 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  32.34 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.15 
 
 		 953 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.15 
 
 		 953 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  33.53 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  32.88 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.34 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  25.39 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  31.55 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 581 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  34.97 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.93 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  38.17 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.35 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  26.29 
 
 		 706 aa  73.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  23.76 
 
 		 951 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  22.26 
 
 		 536 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.95 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  24.78 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  24.01 
 
 		 1052 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  23.01 
 
 		 1033 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  23.68 
 
 		 1062 aa  72.8  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  33.53 
 
 		 549 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  37.06 
 
 		 479 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  33.53 
 
 		 549 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  22.85 
 
 		 385 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>