132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01106 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1394    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  26.47 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  26.47 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.47 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.47 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.31 
 
 
695 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.08 
 
 
696 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  24.76 
 
 
700 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  24.76 
 
 
700 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.35 
 
 
696 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.79 
 
 
706 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.35 
 
 
696 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.84 
 
 
706 aa  154  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.84 
 
 
706 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.27 
 
 
695 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  23.84 
 
 
725 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  23.16 
 
 
717 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.6 
 
 
717 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.39 
 
 
727 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.47 
 
 
727 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.64 
 
 
746 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.68 
 
 
727 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  23 
 
 
727 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  23.51 
 
 
727 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  23.14 
 
 
733 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.95 
 
 
746 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0470  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.35 
 
 
722 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.393999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.03 
 
 
756 aa  94  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  22.92 
 
 
732 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.27 
 
 
725 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.71 
 
 
724 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  23.34 
 
 
731 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  22.8 
 
 
732 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  24.24 
 
 
733 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  23.47 
 
 
733 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  22.61 
 
 
734 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  27.14 
 
 
721 aa  86.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  23.12 
 
 
711 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  22.3 
 
 
883 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.67 
 
 
730 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.71 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  22.69 
 
 
720 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.08 
 
 
851 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  22.85 
 
 
720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  23.12 
 
 
711 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.13 
 
 
727 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  22.71 
 
 
720 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  19.86 
 
 
763 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  21.65 
 
 
712 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  33.77 
 
 
727 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.16 
 
 
719 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  21.83 
 
 
712 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  22.42 
 
 
720 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  21.97 
 
 
737 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  22.42 
 
 
720 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  21.68 
 
 
712 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  23.95 
 
 
711 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  22.27 
 
 
717 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  22.27 
 
 
717 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  22.27 
 
 
720 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  21.5 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  22.27 
 
 
720 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  22.27 
 
 
720 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  20.88 
 
 
758 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  23.55 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  23.32 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  23.55 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  23.55 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.58 
 
 
806 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  26.57 
 
 
717 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.69 
 
 
720 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.16 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  23.21 
 
 
600 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0995  hypothetical protein  26.52 
 
 
700 aa  71.6  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  21.77 
 
 
721 aa  70.9  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  19.44 
 
 
763 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  23.62 
 
 
770 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20.59 
 
 
764 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.44 
 
 
763 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  26.14 
 
 
733 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.78 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.02 
 
 
740 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.52 
 
 
700 aa  67.4  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  21.73 
 
 
790 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  27.36 
 
 
715 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.35 
 
 
763 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.31 
 
 
764 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.31 
 
 
764 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.38 
 
 
738 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>