238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00945 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
226 aa  468  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  94.69 
 
 
226 aa  445  1e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  79.09 
 
 
226 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  76.82 
 
 
227 aa  355  3e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  75.35 
 
 
228 aa  347  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  75.35 
 
 
228 aa  346  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  74.88 
 
 
228 aa  343  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  73.95 
 
 
228 aa  341  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  74.88 
 
 
228 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  72.56 
 
 
229 aa  328  5e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  72.56 
 
 
229 aa  328  5e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  72.56 
 
 
229 aa  327  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  74.42 
 
 
228 aa  327  1e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  74.42 
 
 
228 aa  326  2e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  72.09 
 
 
229 aa  326  2e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  72.09 
 
 
229 aa  326  2e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  72.09 
 
 
229 aa  326  2e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  72.09 
 
 
229 aa  326  2e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  68.47 
 
 
222 aa  326  2e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  72.09 
 
 
229 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  72.09 
 
 
229 aa  325  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  69.68 
 
 
229 aa  323  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  70.7 
 
 
229 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  70.7 
 
 
229 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  70.7 
 
 
229 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  70.7 
 
 
229 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  70.23 
 
 
229 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  69.12 
 
 
221 aa  315  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  66.82 
 
 
223 aa  314  9e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  61.86 
 
 
224 aa  295  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  58.56 
 
 
222 aa  292  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  60.81 
 
 
222 aa  290  9e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  62.79 
 
 
222 aa  288  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  62.21 
 
 
221 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  61.75 
 
 
221 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  60.36 
 
 
222 aa  287  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  61.29 
 
 
221 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  61.26 
 
 
222 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  60.91 
 
 
225 aa  286  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  60.81 
 
 
225 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  61.29 
 
 
221 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 
225 aa  285  3e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  63.85 
 
 
218 aa  283  1e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  61.47 
 
 
229 aa  281  5e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  58.99 
 
 
221 aa  279  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  58.53 
 
 
221 aa  279  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 
219 aa  277  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 
219 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  61.19 
 
 
229 aa  274  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 
219 aa  271  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  59.17 
 
 
232 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  56.68 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  57.6 
 
 
221 aa  269  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  63.96 
 
 
220 aa  269  3e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  59.26 
 
 
218 aa  268  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  56.31 
 
 
231 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  57.53 
 
 
230 aa  267  9e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 
230 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
225 aa  265  6e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  56.68 
 
 
225 aa  265  6e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
225 aa  265  6e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  58.06 
 
 
243 aa  264  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
231 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 
241 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
225 aa  263  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  58.45 
 
 
230 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  56.68 
 
 
225 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 
225 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  57.34 
 
 
231 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  58.45 
 
 
230 aa  261  7e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  57.99 
 
 
230 aa  261  9e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  58.56 
 
 
240 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  55.3 
 
 
225 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 
225 aa  258  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 
225 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  57.99 
 
 
230 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
241 aa  256  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  55.76 
 
 
225 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  55.76 
 
 
225 aa  254  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 
225 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 
225 aa  254  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  55.05 
 
 
223 aa  254  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 
233 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  56.31 
 
 
261 aa  253  2e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  55.35 
 
 
216 aa  253  2e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
253 aa  251  5e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
253 aa  251  5e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  54.95 
 
 
226 aa  251  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  56.48 
 
 
223 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 
231 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  54.19 
 
 
308 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  53.3 
 
 
304 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 
235 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  54.19 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  54.19 
 
 
301 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  53.3 
 
 
304 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  54.19 
 
 
305 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 
224 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 
229 aa  245  5e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
271 aa  244  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>