More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00939 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  61.71 
 
 
820 aa  1029    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.88 
 
 
822 aa  936    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  61.83 
 
 
820 aa  1031    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.42 
 
 
819 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.71 
 
 
820 aa  1030    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.49 
 
 
818 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.44 
 
 
820 aa  1014    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.95 
 
 
820 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4291  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.74 
 
 
825 aa  881    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.64 
 
 
822 aa  938    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.11 
 
 
822 aa  949    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.96 
 
 
819 aa  1060    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.07 
 
 
821 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.59 
 
 
820 aa  1028    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.95 
 
 
820 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.71 
 
 
820 aa  1030    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  86.08 
 
 
819 aa  1419    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03328  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.62 
 
 
804 aa  916    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.25 
 
 
822 aa  939    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  61.71 
 
 
820 aa  1029    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.95 
 
 
820 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  82.91 
 
 
819 aa  1401    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.42 
 
 
819 aa  1043    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.84 
 
 
819 aa  1059    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.53 
 
 
825 aa  930    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.58 
 
 
821 aa  935    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.07 
 
 
820 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.83 
 
 
820 aa  1036    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.76 
 
 
822 aa  933    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.83 
 
 
820 aa  1032    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  57.07 
 
 
820 aa  917    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1214  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.51 
 
 
816 aa  897    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.71 
 
 
820 aa  1029    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.86 
 
 
822 aa  946    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.99 
 
 
822 aa  945    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  100 
 
 
819 aa  1677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.44 
 
 
821 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  61.54 
 
 
819 aa  1045    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.69 
 
 
821 aa  927    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.99 
 
 
822 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  63 
 
 
819 aa  1061    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  56.65 
 
 
821 aa  891    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  60.22 
 
 
820 aa  1036    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.94 
 
 
818 aa  1053    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  96.58 
 
 
819 aa  1599    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.88 
 
 
822 aa  936    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  55.38 
 
 
822 aa  924    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  62.29 
 
 
818 aa  1040    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  40.15 
 
 
823 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.05 
 
 
817 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  37.18 
 
 
818 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.43 
 
 
835 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.39 
 
 
818 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.31 
 
 
835 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.91 
 
 
815 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.28 
 
 
823 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.75 
 
 
835 aa  549  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  36.89 
 
 
814 aa  544  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.96 
 
 
822 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.03 
 
 
815 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.85 
 
 
819 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.12 
 
 
819 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.66 
 
 
815 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.68 
 
 
820 aa  515  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.85 
 
 
834 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  36.65 
 
 
810 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.51 
 
 
819 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  36.76 
 
 
815 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0411  aspartate kinase  33.09 
 
 
804 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.204569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  32.32 
 
 
804 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4045  aspartate kinase  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4426  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4480  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.27821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4075  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5400  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4382  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.810334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4174  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.56 
 
 
810 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2257  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.46 
 
 
803 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03826  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.44 
 
 
810 aa  366  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.087529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03775  hypothetical protein  32.44 
 
 
810 aa  366  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0902999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0190  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.84 
 
 
811 aa  366  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3806  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.48 
 
 
811 aa  362  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4094  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.48 
 
 
811 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4034  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  33.05 
 
 
810 aa  362  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.522954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0122  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.48 
 
 
811 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0121  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.76 
 
 
811 aa  361  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3790  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.27 
 
 
811 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.395473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4318  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.57 
 
 
810 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0537  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.1 
 
 
797 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0513  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.89 
 
 
797 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4348  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.45 
 
 
810 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4435  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.48 
 
 
810 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.941973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3613  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.89 
 
 
797 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4502  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.45 
 
 
810 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3438  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.89 
 
 
797 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0561  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.98 
 
 
797 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3775  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.1 
 
 
797 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0565  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.98 
 
 
797 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0178  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.68 
 
 
811 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4432  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.32 
 
 
810 aa  353  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>