45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00758 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  80.81 
 
 		 198 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  42.71 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  34.78 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  33.54 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  33.54 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  29.8 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  40 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  27.81 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  42.17 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  41.18 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  39.53 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  39.53 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  39.53 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  36.27 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  39.53 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  39.53 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  27.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  27.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  27.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  26.84 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  37.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  37.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  37.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  31.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  35.71 
 
 		 402 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  27.34 
 
 		 439 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32.53 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.19 
 
 		 475 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  26.77 
 
 		 475 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.06 
 
 		 470 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  36.62 
 
 		 472 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  27.7 
 
 		 429 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  22.37 
 
 		 441 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  28.33 
 
 		 491 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  28.07 
 
 		 466 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.51 
 
 		 468 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  22.29 
 
 		 446 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  28.03 
 
 		 418 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.08 
 
 		 447 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32.95 
 
 		 473 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32.95 
 
 		 475 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  27.49 
 
 		 466 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  25.2 
 
 		 474 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  26.06 
 
 		 460 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>