38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00714 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00714  hypothetical protein  100 
 
 		 37 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001757  hypothetical protein  83.78 
 
 		 38 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0412806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  51.35 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  62.5 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  55.88 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  57.58 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  61.76 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  57.58 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  55.88 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  55.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  54.84 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  57.58 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  61.29 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  48.65 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  59.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  54.84 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  55.88 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  54.84 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  58.06 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  52.94 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  55.88 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  54.84 
 
 		 101 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 		 95 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  51.52 
 
 		 107 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  45.45 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  48.48 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  51.52 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>