66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00700 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  46.93 
 
 
557 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  44.83 
 
 
547 aa  453  1e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  42.65 
 
 
550 aa  418  1e-115  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.12421e-12  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  39.5 
 
 
561 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  34.61 
 
 
528 aa  236  1e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  32.3 
 
 
545 aa  221  2e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  31.53 
 
 
587 aa  199  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  31.36 
 
 
680 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  26.9 
 
 
651 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  26.2 
 
 
651 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.2677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  27.87 
 
 
594 aa  142  2e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  23.68 
 
 
603 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  26.23 
 
 
600 aa  127  4e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  7.50178e-06 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  31.94 
 
 
617 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  25.55 
 
 
524 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  24.05 
 
 
568 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  25.06 
 
 
668 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  27.88 
 
 
570 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  27.62 
 
 
570 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  27.45 
 
 
570 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  23.77 
 
 
518 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  25.29 
 
 
610 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  24.49 
 
 
569 aa  92  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  1.68541e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  24.31 
 
 
627 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  22.82 
 
 
548 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  23.44 
 
 
548 aa  90.1  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  23.12 
 
 
630 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.00761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  23.46 
 
 
584 aa  85.9  2e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  26.03 
 
 
573 aa  85.1  3e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  25.94 
 
 
581 aa  84.7  4e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  23.58 
 
 
629 aa  84.7  4e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  8.59361e-08 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  24.41 
 
 
614 aa  80.5  7e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  23.4 
 
 
568 aa  80.5  8e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  25.2 
 
 
573 aa  80.1  9e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  24.09 
 
 
584 aa  75.5  2e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  22.79 
 
 
581 aa  75.5  3e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  24.17 
 
 
584 aa  73.9  6e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  25 
 
 
597 aa  73.9  7e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  24.61 
 
 
584 aa  72.8  1e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  22.93 
 
 
628 aa  72.8  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  23.35 
 
 
580 aa  72.4  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  24.54 
 
 
582 aa  72.4  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  24.11 
 
 
617 aa  71.6  4e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  24.11 
 
 
543 aa  71.2  5e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  22.29 
 
 
592 aa  70.9  6e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  28.39 
 
 
670 aa  70.5  8e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  23.45 
 
 
569 aa  69.3  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  24.63 
 
 
627 aa  69.3  2e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  25 
 
 
702 aa  65.5  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  22.02 
 
 
657 aa  65.5  2e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.0262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  23 
 
 
628 aa  63.5  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  21.41 
 
 
575 aa  62.8  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  22.68 
 
 
584 aa  62.8  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  22.51 
 
 
572 aa  62  2e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  24.71 
 
 
702 aa  62.8  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  23.19 
 
 
702 aa  59.7  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  24.03 
 
 
571 aa  58.2  4e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  21.27 
 
 
630 aa  53.9  7e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  20.98 
 
 
567 aa  53.5  1e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  21.22 
 
 
565 aa  52.4  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  20.76 
 
 
567 aa  51.2  5e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  22.33 
 
 
594 aa  47.8  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  23.95 
 
 
592 aa  47.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  22.22 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  24.58 
 
 
1188 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>