More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00687 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  38.42 
 
 
922 aa  652  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  40.15 
 
 
912 aa  665  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  100 
 
 
897 aa  1837  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  40.69 
 
 
919 aa  681  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  40.04 
 
 
921 aa  670  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  39.6 
 
 
869 aa  638  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.54 
 
 
920 aa  645  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  40.43 
 
 
915 aa  661  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  40.88 
 
 
910 aa  683  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  38.67 
 
 
920 aa  660  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  39.15 
 
 
919 aa  664  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  39.78 
 
 
931 aa  664  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  38.85 
 
 
869 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  37.63 
 
 
852 aa  598  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  33.86 
 
 
828 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  33.95 
 
 
828 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  34.22 
 
 
837 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  34.22 
 
 
837 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  34.13 
 
 
837 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  33.95 
 
 
828 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  40.94 
 
 
827 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.57 
 
 
833 aa  344  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  30.65 
 
 
1055 aa  255  2e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.68 
 
 
833 aa  245  2e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  33.71 
 
 
753 aa  243  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.12 
 
 
948 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
834 aa  236  1e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.26 
 
 
977 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  26.88 
 
 
947 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.93 
 
 
781 aa  222  2e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  27.81 
 
 
952 aa  221  4e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27 
 
 
869 aa  218  6e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.58 
 
 
779 aa  216  2e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  30.49 
 
 
936 aa  216  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  29.02 
 
 
812 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.13 
 
 
830 aa  202  2e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.28 
 
 
824 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  30.17 
 
 
940 aa  192  3e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
823 aa  191  6e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.65 
 
 
877 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  31.95 
 
 
803 aa  184  5e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.49 
 
 
877 aa  184  9e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  32.77 
 
 
875 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.49 
 
 
800 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  28.93 
 
 
800 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  32.24 
 
 
849 aa  175  3e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  30.48 
 
 
791 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  25.98 
 
 
830 aa  171  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.54 
 
 
846 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  36.49 
 
 
576 aa  166  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.06 
 
 
568 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.09 
 
 
580 aa  113  1e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.37 
 
 
478 aa  111  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.16 
 
 
473 aa  111  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  23.31 
 
 
606 aa  104  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
603 aa  101  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  34.03 
 
 
425 aa  101  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.86 
 
 
347 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  26.91 
 
 
537 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  8.56367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.66 
 
 
552 aa  97.4  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
264 aa  96.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.2 
 
 
552 aa  95.1  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
351 aa  94.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  25.77 
 
 
605 aa  94.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.55 
 
 
552 aa  94  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  27.21 
 
 
558 aa  94  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.28 
 
 
552 aa  94  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.23 
 
 
495 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  24.92 
 
 
495 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  23.28 
 
 
551 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  24.21 
 
 
478 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.52 
 
 
378 aa  89  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.97973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
282 aa  88.6  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.77 
 
 
264 aa  88.6  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  24.91 
 
 
516 aa  88.2  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.55 
 
 
579 aa  88.2  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.39 
 
 
703 aa  86.7  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  25.2 
 
 
356 aa  85.9  3e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  26.88 
 
 
565 aa  85.5  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  27.49 
 
 
700 aa  85.5  4e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  27.8 
 
 
281 aa  84.7  6e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  27.1 
 
 
700 aa  84.3  9e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.05 
 
 
268 aa  84  1e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  24.27 
 
 
492 aa  83.6  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  26.95 
 
 
365 aa  83.6  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  27.88 
 
 
277 aa  82.8  2e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.1 
 
 
386 aa  82.4  3e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.64 
 
 
386 aa  82  4e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.16 
 
 
317 aa  82  4e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.09 
 
 
388 aa  81.6  5e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  23.5 
 
 
587 aa  81.6  5e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.16 
 
 
386 aa  81.3  7e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.16 
 
 
386 aa  81.3  7e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.16 
 
 
379 aa  81.3  8e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.16 
 
 
379 aa  81.3  8e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.16 
 
 
379 aa  81.3  8e-14  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.16 
 
 
379 aa  81.3  8e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.57 
 
 
270 aa  80.5  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.18 
 
 
378 aa  80.1  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.65 
 
 
268 aa  80.1  2e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>