More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00638 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  100 
 
 		 827 aa  1688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 855 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 871 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 852 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 861 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 861 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 861 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 847 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 849 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 861 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 861 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 861 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 857 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 869 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 874 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 875 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 879 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 890 aa  353  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 890 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  34.22 
 
 		 866 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 867 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 867 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 867 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 867 aa  344  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 890 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 927 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 866 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 928 aa  333  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 891 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 883 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 883 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 913 aa  324  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.8 
 
 		 884 aa  324  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 914 aa  324  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 906 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 883 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 896 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 924 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 924 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 924 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  29.28 
 
 		 834 aa  311  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 909 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 935 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 843 aa  300  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1055 aa  300  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 950 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 841 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 941 aa  298  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 941 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 941 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 895 aa  296  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 896 aa  296  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 842 aa  295  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 944 aa  294  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 882 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 		 893 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 882 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.55 
 
 		 880 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 886 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 904 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 901 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 948 aa  290  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.31 
 
 		 877 aa  290  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 886 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 956 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 909 aa  290  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 892 aa  287  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  29.52 
 
 		 839 aa  286  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 894 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 903 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 836 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 869 aa  282  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  27.91 
 
 		 899 aa  282  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 872 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 869 aa  278  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 876 aa  277  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 894 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 868 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 884 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 965 aa  271  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 873 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 838 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 935 aa  269  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 901 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 853 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  29.1 
 
 		 853 aa  268  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1006 aa  268  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 855 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 925 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 953 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 873 aa  265  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 981 aa  265  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 855 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 937 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 817 aa  261  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>