284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00434 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  93.06 
 
 		 144 aa  280  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  74.31 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  55.4 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.94 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  47.79 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  47.79 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  50 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  50 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  50 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  50 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  46.38 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  46.38 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  46.38 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  47.79 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  50 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  44.76 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  50 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  47.79 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  48.18 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  50 
 
 		 147 aa  137  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  49.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  49.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  47.06 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  47.06 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  47.83 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  46.32 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  44.85 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  44.2 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  44.14 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  46.32 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.14 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.17 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  41.26 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  43.48 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  42.03 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  42.03 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  40.58 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  42.75 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.7 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  39.86 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  38.22 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  39.29 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  36.69 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  37.41 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  36.69 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  36.69 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  38.62 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  35.97 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  37.16 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.97 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  34.29 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  35 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  34.53 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.57 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  34.29 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  34.29 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  37.32 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  35 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  33.57 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  35 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  35 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  37.24 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  33.57 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  37.32 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  39.44 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  30.43 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  37.86 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  37.32 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  31.43 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  34.29 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  36.24 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.72 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  36.05 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  30.43 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  33.81 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  36.88 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  29.93 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  32.37 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  32.14 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  32.37 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  32.37 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  32.37 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  32.86 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  31.65 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  31.65 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.99 
 
 		 607 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  34.04 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.11 
 
 		 584 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  31.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  31.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  37.5 
 
 		 1370 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  31.43 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>