199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00404 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  92 
 
 		 200 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  79.5 
 
 		 200 aa  343  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  68.02 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  64.65 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  61.81 
 
 		 211 aa  258  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  61.81 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.65 
 
 		 202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  46.84 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.28 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  41.49 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  37.56 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.09 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.62 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.47 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  40.56 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.8 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.21 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  40.8 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.36 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.36 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  42.13 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.36 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.44 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  40.56 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  38.81 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.12 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.68 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  35.78 
 
 		 202 aa  111  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  30.16 
 
 		 293 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  30.56 
 
 		 249 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 250 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 250 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.68 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 251 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 		 250 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 250 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 250 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.69 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.65 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.28 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.16 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 217 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  27.66 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.27 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.26 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.21 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.22 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.25 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>