273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00298 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  100 
 
 		 407 aa  841    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  83.54 
 
 		 407 aa  707    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  62.96 
 
 		 408 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  54.64 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  45.81 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  44.36 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  43.49 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  36.45 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  37.12 
 
 		 409 aa  295  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  36.39 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  36.88 
 
 		 406 aa  282  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  36.75 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  37.78 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 		 413 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  37.28 
 
 		 405 aa  255  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 		 415 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  35.54 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  36.87 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  32.93 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  34.06 
 
 		 413 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 411 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  31 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  33.86 
 
 		 416 aa  212  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.52 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.51 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.95 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  32.5 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  30.87 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.79 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  31.67 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.16 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  31 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  32.1 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  31.06 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  31.72 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  31.16 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  30.07 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.35 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  29.08 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  29.53 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  29.6 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.85 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  29.54 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  27.49 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.41 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.21 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  29.97 
 
 		 448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.21 
 
 		 423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.24 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.44 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.8 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  27.98 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  29.22 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.34 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  26.73 
 
 		 460 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.75 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.06 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  26.37 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  24.14 
 
 		 480 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  28.88 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.99 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.86 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  22.22 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  29.57 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  31.4 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  28.51 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  21.81 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.78 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  22.62 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  21.4 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  27.38 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  28.06 
 
 		 242 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.61 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  29.84 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  30.91 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  28.79 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>