161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00275 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  100 
 
 		 280 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  90 
 
 		 280 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  65.59 
 
 		 277 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  64.29 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  44.44 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  45.59 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  44.44 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  42.81 
 
 		 274 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  42.14 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  43.38 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  42.14 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  42.14 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  42.29 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  43.46 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  41.79 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  44.4 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  43.21 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  43.21 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  42.81 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  41.96 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  43.21 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  42.86 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  42.81 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  43.01 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  42.45 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  42.2 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  40.71 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  41.03 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  41.03 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  41.03 
 
 		 276 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  41.11 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  39.43 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  41.11 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  41.45 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  42.39 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  40.07 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  40.5 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  38.63 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  36.11 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  35.21 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  29.25 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  41.33 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  30.96 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  30.96 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  35.47 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  41.18 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  31.15 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  31.68 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  30.11 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  38 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  30.36 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  41.01 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  39.85 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  38.06 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.55 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  26.44 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.88 
 
 		 486 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  25 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  27.23 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  28.82 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.67 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  25 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  31.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.26 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.26 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  30.56 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  28.72 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  25.12 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  27.96 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  32.3 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  27.27 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  33.75 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  25.54 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  33.75 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  32.5 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  31.4 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  26.12 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  26.12 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  26.12 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  28.04 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  26.7 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  26.6 
 
 		 444 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  27.36 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  29.08 
 
 		 376 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3898  Rhomboid family protein  39.06 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>