More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00240 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  100 
 
 
321 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  78.82 
 
 
321 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  68.03 
 
 
320 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  53.58 
 
 
320 aa  358  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  53.89 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  53.89 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  53.89 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  53.89 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  53.89 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  53.27 
 
 
320 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  52.66 
 
 
319 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  52.34 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  52.02 
 
 
321 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  52.2 
 
 
319 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  52.2 
 
 
319 aa  347  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  52.2 
 
 
319 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  53.14 
 
 
319 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  52.52 
 
 
319 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  52.2 
 
 
319 aa  342  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  51.1 
 
 
319 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  47.65 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  46.82 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  48.72 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  48.4 
 
 
319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  48.4 
 
 
319 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  48.73 
 
 
323 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  48.4 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  48.06 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  47.76 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  47.73 
 
 
333 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  46.52 
 
 
328 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  47.44 
 
 
319 aa  298  9e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  47.19 
 
 
320 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  47.12 
 
 
319 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  46.67 
 
 
320 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  46.96 
 
 
317 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  46.79 
 
 
319 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  45.77 
 
 
320 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  47.44 
 
 
319 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  41.43 
 
 
328 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  41.46 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  40.63 
 
 
319 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  40.06 
 
 
332 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  39.81 
 
 
331 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  39.56 
 
 
335 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  40.32 
 
 
312 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  42.09 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  38.03 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  37.79 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.37 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  39.43 
 
 
319 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.88 
 
 
326 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  40.69 
 
 
321 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.19 
 
 
319 aa  208  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  40.51 
 
 
319 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  40.32 
 
 
319 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.51 
 
 
325 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  40.3 
 
 
282 aa  206  6e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  37.66 
 
 
310 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  34.77 
 
 
323 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  34.77 
 
 
323 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  38.75 
 
 
330 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  38.49 
 
 
293 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.59 
 
 
317 aa  185  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.46 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  35.96 
 
 
317 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  35.65 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  37.69 
 
 
322 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.14 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.39 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1987  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.28 
 
 
338 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.417612  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2817  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.36 
 
 
336 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.85 
 
 
325 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  36.16 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.1 
 
 
328 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.23 
 
 
321 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.59 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.39 
 
 
326 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  30.45 
 
 
325 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0663  BirA bifunctional protein  31.93 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0814484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1935  birA biofunctional protein, putative  32.7 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.976784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1903  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.21 
 
 
327 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.37759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3720  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.48 
 
 
344 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.071565  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0244  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.9 
 
 
329 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  0.860661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2320  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.9 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0571544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0664  BirA bifunctional protein  31.33 
 
 
328 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2431  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.02 
 
 
330 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  30.6 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1476  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.26 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.841583  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3652  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.07 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0948912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  31.37 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1479  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.89 
 
 
329 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0876973  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2388  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.01 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0131534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>