More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00150 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  100 
 
 		 468 aa  958    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  84.88 
 
 		 464 aa  795    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  67.24 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  65.72 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  60.75 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  44.25 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  44.42 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  44.42 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  44.42 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  44.86 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  44.69 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  44.69 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  44.69 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  44.69 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  44.9 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  44.9 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  45.34 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  45.39 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  44.86 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  45.18 
 
 		 456 aa  306  7e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  43.98 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  38.13 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.26 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 449 aa  245  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.04 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  33.48 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  33.98 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.89 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  34.6 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  35.67 
 
 		 472 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  37.54 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  30.51 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  36.33 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 442 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.31 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  35.97 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.88 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  29.7 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  33.22 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.93 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  33.87 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 330 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.55 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  30.74 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3010  histidine kinase  33.58 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 717 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  31.25 
 
 		 276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  29.18 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  28.77 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 563 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  28.49 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  29.8 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  28.49 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  28.77 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  29.8 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  29.8 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  29.8 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  28.77 
 
 		 436 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  33.81 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2747  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.9 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  29.02 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>