286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00052 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  100 
 
 
172 aa  343  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  97.47 
 
 
158 aa  313  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  87.34 
 
 
158 aa  292  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  80 
 
 
157 aa  258  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  75.82 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  74.51 
 
 
156 aa  235  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  73.03 
 
 
158 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  73.03 
 
 
158 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  72.61 
 
 
157 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  71.97 
 
 
157 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  71.97 
 
 
157 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  70.25 
 
 
158 aa  230  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  70.89 
 
 
158 aa  230  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  71.34 
 
 
157 aa  228  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  72.55 
 
 
159 aa  227  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  70.7 
 
 
157 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  70.06 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  71.24 
 
 
157 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  71.24 
 
 
157 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  71.24 
 
 
157 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  72.55 
 
 
154 aa  221  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  69.87 
 
 
156 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  69.87 
 
 
156 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  70.59 
 
 
154 aa  221  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  71.24 
 
 
159 aa  220  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  68.15 
 
 
158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  68.15 
 
 
158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  68.15 
 
 
158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  68.15 
 
 
158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  69.28 
 
 
157 aa  217  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  68.63 
 
 
157 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  69.28 
 
 
158 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  68.63 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  68.63 
 
 
159 aa  213  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  68.63 
 
 
159 aa  213  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  69.08 
 
 
154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  64.71 
 
 
158 aa  208  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  66.01 
 
 
159 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  66.67 
 
 
159 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  66.01 
 
 
158 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  67.33 
 
 
156 aa  204  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  64.71 
 
 
158 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  64.71 
 
 
159 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  63.16 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  62.66 
 
 
160 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  62.75 
 
 
158 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  62.18 
 
 
224 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  63.82 
 
 
159 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  59.88 
 
 
180 aa  201  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  63.82 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  64.05 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  64.05 
 
 
159 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  61.44 
 
 
159 aa  196  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  63.16 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  62.75 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  60.9 
 
 
158 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  62.75 
 
 
158 aa  195  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  60.9 
 
 
158 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  61.84 
 
 
158 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  62.75 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  62.66 
 
 
158 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  60.53 
 
 
159 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  62.5 
 
 
158 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  60.13 
 
 
154 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  61.84 
 
 
159 aa  191  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  60.53 
 
 
158 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  61.44 
 
 
158 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  60.78 
 
 
154 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  69.08 
 
 
157 aa  188  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  61.33 
 
 
154 aa  187  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  61.33 
 
 
154 aa  187  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  62.59 
 
 
162 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  62.75 
 
 
160 aa  184  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  59.21 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  56.86 
 
 
158 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  62.18 
 
 
156 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  59.87 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  59.21 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1168  bacterioferritin, subunit 2  57.24 
 
 
155 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>