More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00037 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.85 
 
 		 482 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.96 
 
 		 484 aa  902    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.29 
 
 		 487 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.86 
 
 		 490 aa  953    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.29 
 
 		 487 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.05 
 
 		 489 aa  658    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.29 
 
 		 487 aa  753    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 490 aa  1010    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.12 
 
 		 483 aa  680    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.78 
 
 		 488 aa  911    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.18 
 
 		 484 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.12 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.85 
 
 		 479 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.89 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.14 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.42 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.67 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.95 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.76 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.69 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.65 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.03 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.3 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 		 511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 		 470 aa  339  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.13 
 
 		 515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 473 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 		 511 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.59 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.25 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.81 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.81 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.27 
 
 		 767 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.83 
 
 		 473 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  30.43 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  29.14 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.11 
 
 		 767 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 465 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  27.39 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.81 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.11 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.36 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.63 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.13 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.78 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 		 585 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 		 475 aa  160  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.8 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.98 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 		 461 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  29.33 
 
 		 515 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  27.52 
 
 		 466 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.23 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.96 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  28.08 
 
 		 745 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.27 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.83 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 465 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  29.44 
 
 		 551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  29.36 
 
 		 550 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.8 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.48 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.92 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.74 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  29.11 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.03 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.71 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  28.27 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  29.41 
 
 		 516 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.79 
 
 		 474 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.74 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.77 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  29.96 
 
 		 564 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  29.27 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.14 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  28.33 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  29.75 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.84 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>