More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004481 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  94.05 
 
 		 269 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  82.16 
 
 		 269 aa  467  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  76.58 
 
 		 269 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  63.57 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  64.55 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  63.06 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  64.18 
 
 		 273 aa  344  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  63.81 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  61.57 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  62.03 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  62.03 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  62.31 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  62.31 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  62.31 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  62.31 
 
 		 273 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  61.42 
 
 		 267 aa  341  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  63.16 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  61.28 
 
 		 270 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  61.65 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  60.3 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  60.3 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  60.3 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 271 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  60.67 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  60.67 
 
 		 267 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  60.82 
 
 		 273 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  59.93 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  60.67 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  60.45 
 
 		 273 aa  329  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  61.19 
 
 		 273 aa  328  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  58.43 
 
 		 271 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  60.3 
 
 		 267 aa  327  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  60.07 
 
 		 268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  60.07 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  62.69 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  61.94 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  61.94 
 
 		 273 aa  321  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  61.57 
 
 		 273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  55.26 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  57.89 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  58.05 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  57.25 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  60.07 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  58.05 
 
 		 269 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  56.34 
 
 		 268 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  55.85 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  56.44 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  56.02 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 268 aa  292  5e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  51.49 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  54.34 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  53.56 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  52.45 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  53.18 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  52.81 
 
 		 266 aa  278  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  54.31 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  52.06 
 
 		 266 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  52.63 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  51.31 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  51.31 
 
 		 269 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  54.92 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  51.49 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  51.5 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  52.43 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  51.69 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  50.59 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  50.94 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  50.75 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>