More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004405 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  84.8 
 
 
375 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  97.6 
 
 
375 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  75.94 
 
 
377 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.65 
 
 
373 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.39 
 
 
373 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.39 
 
 
373 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.39 
 
 
373 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.49 
 
 
373 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
373 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  65.77 
 
 
373 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
373 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.5 
 
 
373 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.23 
 
 
373 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.23 
 
 
373 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.88 
 
 
373 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.23 
 
 
373 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.23 
 
 
373 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.69 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.23 
 
 
375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
373 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
372 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  60 
 
 
379 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.51 
 
 
384 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.78 
 
 
379 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.19 
 
 
379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.19 
 
 
379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.65 
 
 
379 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.92 
 
 
379 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.92 
 
 
379 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.11 
 
 
383 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.84 
 
 
383 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.84 
 
 
383 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.84 
 
 
383 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.59 
 
 
374 aa  443  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.84 
 
 
379 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.18 
 
 
375 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.76 
 
 
384 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.39 
 
 
384 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.95 
 
 
383 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.13 
 
 
381 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.95 
 
 
384 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  41.98 
 
 
706 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  30.97 
 
 
371 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  37.85 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 
274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 
283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 
276 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
274 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
505 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.45 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  29.62 
 
 
437 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
242 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  27.36 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.75 
 
 
351 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 
373 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  28.3 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  29.78 
 
 
259 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  30.2 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 
258 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  26.5 
 
 
262 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.71 
 
 
346 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  24.14 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  25.32 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  25.62 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  25.96 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  22.73 
 
 
287 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  24.89 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  22.41 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  24.12 
 
 
332 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
258 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
287 aa  62.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
258 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.98 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.71 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  38.04 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  23.47 
 
 
279 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  37.65 
 
 
107 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  21.43 
 
 
276 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  21.74 
 
 
275 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.15 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  21.81 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>