190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004277 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  48.65 
 
 		 737 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  48.23 
 
 		 744 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  100 
 
 		 730 aa  1501    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  49.36 
 
 		 737 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  48.49 
 
 		 739 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  48.76 
 
 		 739 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  48.9 
 
 		 739 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  47.83 
 
 		 737 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  48.35 
 
 		 739 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.78 
 
 		 849 aa  343  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  30.11 
 
 		 851 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  28.51 
 
 		 851 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.88 
 
 		 681 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.24 
 
 		 676 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 681 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  29.01 
 
 		 314 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.48 
 
 		 689 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.07 
 
 		 697 aa  124  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.82 
 
 		 696 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.51 
 
 		 695 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.54 
 
 		 696 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.41 
 
 		 696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.82 
 
 		 696 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.92 
 
 		 677 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.34 
 
 		 688 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.03 
 
 		 690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.39 
 
 		 696 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 800 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.85 
 
 		 657 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.24 
 
 		 697 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.23 
 
 		 704 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 652 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 		 670 aa  108  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.2 
 
 		 490 aa  107  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.01 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 667 aa  99  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 		 734 aa  97.8  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  22.12 
 
 		 771 aa  94.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 649 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.79 
 
 		 717 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.13 
 
 		 685 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.64 
 
 		 661 aa  90.9  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  23.47 
 
 		 693 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.77 
 
 		 660 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.77 
 
 		 660 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 693 aa  81.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  21.01 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  28.7 
 
 		 659 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.68 
 
 		 743 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.37 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 		 694 aa  79.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  30.96 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.25 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  22.73 
 
 		 683 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  28.29 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 668 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 684 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  25.95 
 
 		 778 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  27.05 
 
 		 654 aa  75.1  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  28.63 
 
 		 661 aa  74.7  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  29.7 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30 
 
 		 779 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.04 
 
 		 783 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.27 
 
 		 867 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 687 aa  70.5  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.48 
 
 		 859 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  20.9 
 
 		 862 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.09 
 
 		 676 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  22.09 
 
 		 676 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  28.14 
 
 		 693 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 698 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 683 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.14 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.11 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  21.88 
 
 		 676 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 665 aa  65.1  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1018 aa  65.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.17 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  20.51 
 
 		 861 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  27.42 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.03 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.79 
 
 		 655 aa  61.6  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  20.22 
 
 		 857 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  25.06 
 
 		 668 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  26.39 
 
 		 942 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 756 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  26.92 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.63 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.84 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  19.71 
 
 		 716 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  24.33 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 719 aa  57.4  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.02 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.92 
 
 		 675 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.8 
 
 		 1023 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>