More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004175 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  97.08 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  86.69 
 
 		 308 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  80.72 
 
 		 306 aa  517  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  63.64 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  64.08 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  64.22 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  64.22 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  64.22 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  62.99 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  64.22 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  63.58 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  64.08 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  62.99 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  62.99 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  62.99 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  62.66 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  62.99 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  62.99 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  63.75 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  61.18 
 
 		 306 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  57.05 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  58.09 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  60 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  57.76 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  56.67 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  57.43 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  55.91 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  57.89 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  59.16 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  56.77 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  56.07 
 
 		 309 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  57.24 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  57.24 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  57.24 
 
 		 309 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  58.42 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  51.79 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  51.14 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  49.36 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  50.16 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  50.16 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 		 311 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  50.16 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  49.04 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  50.82 
 
 		 313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  52.15 
 
 		 309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  48.85 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  47.57 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  49.04 
 
 		 314 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  48.56 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  47.27 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  57.32 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  47.59 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  47.28 
 
 		 314 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  48.23 
 
 		 338 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  48.85 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  46.65 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  46.65 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  46.65 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  46.65 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  48.68 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  46.96 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  46.33 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.39 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.39 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  46.3 
 
 		 313 aa  278  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  46.5 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  47.57 
 
 		 319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  45.08 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  44.44 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  45.1 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  46.67 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  42.63 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  39.86 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  39.32 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  39.44 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  39.44 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  38.98 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  39.58 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  37.07 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  38.98 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  37.34 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  38.73 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  36.92 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.69 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  34.97 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  36.11 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  40.28 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  39.22 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  38.52 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  38.52 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  38.11 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  37.99 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  38.16 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  38.87 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  38.87 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>