More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004162 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  100 
 
 
384 aa  771    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  95.57 
 
 
384 aa  740    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  75.84 
 
 
379 aa  587  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  70.21 
 
 
379 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  66.67 
 
 
377 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  66.67 
 
 
377 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  64.42 
 
 
402 aa  488  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  64.84 
 
 
376 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  63.71 
 
 
377 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  65.54 
 
 
375 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  64.32 
 
 
376 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  66.32 
 
 
377 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  66.32 
 
 
377 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  63.97 
 
 
377 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  64.06 
 
 
377 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  64.06 
 
 
377 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  62.34 
 
 
378 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  62.92 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  63.54 
 
 
376 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  58.18 
 
 
378 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  58.07 
 
 
385 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  45.14 
 
 
374 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  45.14 
 
 
374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.41 
 
 
387 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  46.91 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  46.67 
 
 
393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  43.46 
 
 
467 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  43.46 
 
 
468 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  42.45 
 
 
405 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  41.71 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.68 
 
 
392 aa  262  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  39.29 
 
 
404 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  40.51 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.46 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  34.21 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.46 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.95 
 
 
404 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  38.1 
 
 
462 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  41.82 
 
 
319 aa  239  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  41.45 
 
 
319 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.65 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  39.05 
 
 
388 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  35.67 
 
 
431 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  37.78 
 
 
376 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  37.5 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  36.83 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  38.56 
 
 
356 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
484 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
485 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  37.19 
 
 
386 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  35.13 
 
 
379 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  36.36 
 
 
390 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  53.69 
 
 
687 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  58.96 
 
 
481 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  36.18 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  61.31 
 
 
516 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  57.56 
 
 
492 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  57.76 
 
 
488 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  60.12 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.18 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  35.55 
 
 
369 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  35.55 
 
 
369 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  35.13 
 
 
289 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  56.07 
 
 
482 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  50.78 
 
 
506 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.55 
 
 
387 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  34.94 
 
 
412 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  35.24 
 
 
404 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  40.99 
 
 
483 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  34 
 
 
386 aa  185  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  53.26 
 
 
273 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  54.55 
 
 
493 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  51.3 
 
 
273 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  32.35 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  54.17 
 
 
492 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.37 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  53.29 
 
 
490 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  58.71 
 
 
272 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  58.71 
 
 
272 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  47.94 
 
 
501 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  52.72 
 
 
273 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  33.42 
 
 
384 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  33.42 
 
 
384 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  59.35 
 
 
271 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  51.09 
 
 
282 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  52.49 
 
 
294 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  53.37 
 
 
274 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  33.64 
 
 
420 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  58.97 
 
 
272 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>