More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004161 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  95.23 
 
 
377 aa  719  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  95.23 
 
 
377 aa  716  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  100 
 
 
377 aa  753  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  84.35 
 
 
377 aa  636  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  100 
 
 
377 aa  753  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  80.64 
 
 
377 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  77.19 
 
 
376 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  76.92 
 
 
376 aa  577  1e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  72.34 
 
 
402 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  71.09 
 
 
375 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  69.76 
 
 
377 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  69.5 
 
 
377 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  72.15 
 
 
376 aa  516  1e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  69.05 
 
 
379 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  70.37 
 
 
379 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  67.2 
 
 
378 aa  508  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  66.58 
 
 
384 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  65.8 
 
 
384 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  66.05 
 
 
377 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  63.03 
 
 
385 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  63.83 
 
 
378 aa  471  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  52.67 
 
 
374 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.39786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  52.8 
 
 
374 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  50.25 
 
 
394 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  49.87 
 
 
393 aa  329  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.24 
 
 
387 aa  303  2e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.91 
 
 
405 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  40.74 
 
 
395 aa  263  5e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.66 
 
 
392 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.97 
 
 
319 aa  255  1e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.82 
 
 
319 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  42.16 
 
 
404 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.98 
 
 
404 aa  245  1e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  39.59 
 
 
390 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  39.59 
 
 
390 aa  240  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  40.1 
 
 
388 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  36.72 
 
 
462 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  38.9 
 
 
375 aa  232  7e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  35.11 
 
 
488 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  40.21 
 
 
376 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  40.16 
 
 
356 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  37.01 
 
 
431 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  39.25 
 
 
386 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  68.24 
 
 
468 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  67.06 
 
 
467 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  68.9 
 
 
484 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  67.68 
 
 
485 aa  221  2e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  36.22 
 
 
437 aa  220  4e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  38.15 
 
 
380 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  62.43 
 
 
482 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  63.01 
 
 
481 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.06 
 
 
383 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59197e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.32 
 
 
327 aa  214  2e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  37.44 
 
 
369 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  37.44 
 
 
369 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  38.96 
 
 
373 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  54.13 
 
 
517 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  36.15 
 
 
420 aa  209  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  53.21 
 
 
516 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  38.63 
 
 
390 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  54.15 
 
 
687 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  36.93 
 
 
404 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
492 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  50 
 
 
488 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  33.93 
 
 
379 aa  201  2e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  35.4 
 
 
387 aa  199  9e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  34.67 
 
 
384 aa  196  4e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  34.67 
 
 
384 aa  196  4e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  37.98 
 
 
412 aa  196  5e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  35.93 
 
 
387 aa  196  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  34.52 
 
 
391 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 
271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 
271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  36.57 
 
 
388 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 
271 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 
271 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
272 aa  191  3e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
272 aa  191  3e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  47.62 
 
 
494 aa  189  6e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 
483 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  60.12 
 
 
273 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
275 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  59.51 
 
 
294 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  60.49 
 
 
274 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  62.18 
 
 
274 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  54.79 
 
 
294 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  59.26 
 
 
275 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  58.39 
 
 
270 aa  185  1e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  37.56 
 
 
385 aa  184  2e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
273 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  34.85 
 
 
420 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  52.57 
 
 
475 aa  183  5e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  58.9 
 
 
272 aa  182  8e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  59.88 
 
 
273 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  55.69 
 
 
490 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  52 
 
 
475 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  58.9 
 
 
272 aa  180  3e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  57.41 
 
 
273 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>