More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004134 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  100 
 
 
462 aa  933  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  91.99 
 
 
462 aa  880  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  75.06 
 
 
451 aa  697  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  61.93 
 
 
501 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  62.14 
 
 
501 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.64206e-06  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  61.73 
 
 
501 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.44318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  62.24 
 
 
489 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.02128e-07  hitchhiker  7.91426e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  62.03 
 
 
489 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.07679e-08  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  62.03 
 
 
489 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  64.09 
 
 
489 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.17071e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  62.37 
 
 
491 aa  583  1e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  62.96 
 
 
490 aa  581  1e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.1541e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  60.49 
 
 
500 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.47826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  61.33 
 
 
501 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  62.66 
 
 
490 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.91592e-07  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  62.2 
 
 
489 aa  573  1e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  60.7 
 
 
501 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  55.7 
 
 
479 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  47.83 
 
 
461 aa  406  1e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40471e-06  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  47.51 
 
 
461 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.79304e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  47.61 
 
 
461 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  47.51 
 
 
461 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.9773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  47.29 
 
 
461 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87987e-11 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  47.51 
 
 
461 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  8.22499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  47.61 
 
 
461 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.67379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  47.51 
 
 
461 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.79263e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  47.29 
 
 
461 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.69558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  46.96 
 
 
461 aa  399  1e-110  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.92962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  45.3 
 
 
461 aa  399  1e-110  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  48.84 
 
 
463 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  45.73 
 
 
461 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84184e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  45.51 
 
 
461 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  48.25 
 
 
463 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  46.09 
 
 
463 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  46.07 
 
 
446 aa  378  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  46.07 
 
 
446 aa  378  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  47.61 
 
 
464 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  61.08 
 
 
324 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  46.09 
 
 
449 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  46.31 
 
 
449 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  46.31 
 
 
449 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.99815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  47.52 
 
 
467 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  45.64 
 
 
449 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38038e-07  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  45.08 
 
 
452 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  46.97 
 
 
504 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  45.08 
 
 
452 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.52854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  45.11 
 
 
444 aa  362  7e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  43.64 
 
 
436 aa  346  6e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  3.08736e-09  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  48.47 
 
 
395 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.14111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.05 
 
 
432 aa  339  5e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  40.08 
 
 
501 aa  321  2e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  40.91 
 
 
471 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  39.44 
 
 
497 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  38.2 
 
 
496 aa  312  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.42 
 
 
477 aa  310  3e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.22625e-05  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  37.33 
 
 
517 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  37.04 
 
 
527 aa  307  2e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.56 
 
 
517 aa  303  6e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.18 
 
 
495 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  35.77 
 
 
497 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  38.53 
 
 
497 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  38.34 
 
 
498 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.38 
 
 
499 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  4.22142e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  35.23 
 
 
495 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  36.61 
 
 
516 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  37.17 
 
 
510 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  37.25 
 
 
510 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  37.42 
 
 
499 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.65 
 
 
512 aa  275  1e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.65 
 
 
512 aa  275  1e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  35.56 
 
 
507 aa  274  2e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  37.09 
 
 
520 aa  273  4e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  36.73 
 
 
544 aa  273  4e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  34.57 
 
 
524 aa  267  3e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
501 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  33.06 
 
 
501 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  36.08 
 
 
544 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  35.83 
 
 
483 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  34.58 
 
 
497 aa  255  1e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.97 
 
 
502 aa  253  4e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  33.94 
 
 
566 aa  246  5e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  33.86 
 
 
490 aa  246  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 
482 aa  245  1e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.25 
 
 
501 aa  245  1e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  32.01 
 
 
498 aa  245  1e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.67951e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  32.35 
 
 
499 aa  245  2e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.59644e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  36.18 
 
 
445 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  32.67 
 
 
483 aa  241  3e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  32.06 
 
 
484 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  40.33 
 
 
533 aa  237  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  35.08 
 
 
558 aa  235  1e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  34.79 
 
 
482 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  31.37 
 
 
517 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
489 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.16 
 
 
516 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 
497 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  31.4 
 
 
486 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  29.96 
 
 
511 aa  215  1e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  32.81 
 
 
501 aa  214  2e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  31.58 
 
 
500 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>