248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004082 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  100 
 
 		 371 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  85.14 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  77.75 
 
 		 405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  77.48 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  75.74 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  75.47 
 
 		 402 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  75.74 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  75.74 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  72.7 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  58.45 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  54.84 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  55.61 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  53.94 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  54.3 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  52.62 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  53.49 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  54.18 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  53.37 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  54.4 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  50.13 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  54.47 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  52.73 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  54.16 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  53.83 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  55.38 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  53.08 
 
 		 427 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  52.05 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  54.45 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  51.3 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  53.25 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  51.04 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  51.96 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  52.47 
 
 		 419 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  51.95 
 
 		 419 aa  362  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  52.22 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.65 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  51.43 
 
 		 419 aa  358  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  50.75 
 
 		 432 aa  358  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  52.29 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  48.83 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  47.16 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  49.87 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  47.56 
 
 		 422 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  53.14 
 
 		 414 aa  352  8e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  51.97 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  52.21 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  51.95 
 
 		 419 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  54.73 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  54.73 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  54.73 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  53.76 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  46.65 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  48.56 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  52.3 
 
 		 425 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  46.27 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  46.27 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  46.27 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  46.27 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  52.28 
 
 		 425 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  46.27 
 
 		 424 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  46.17 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  46.43 
 
 		 566 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  46.79 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  46.52 
 
 		 408 aa  322  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  44.99 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  44.94 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  44.44 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  46.76 
 
 		 401 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  43.44 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  44.99 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  44.99 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  46.76 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  44.99 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.93 
 
 		 416 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  43.36 
 
 		 403 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  44.17 
 
 		 403 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.41 
 
 		 416 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  43.36 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  45.93 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.99 
 
 		 413 aa  302  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  43.49 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5501  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  43.92 
 
 		 416 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0332  Na+ dependent nucleoside transporter-like  43.91 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0394  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.25 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  44.47 
 
 		 415 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  43.9 
 
 		 403 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  44.51 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  43.63 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  43.63 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  43.63 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  43.63 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  43.63 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  43.36 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2802  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  40.16 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0863709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0289  Na+ dependent nucleoside transporter  43.09 
 
 		 416 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>