69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004000 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  98.47 
 
 
195 aa  390  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  93.37 
 
 
196 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  87.69 
 
 
196 aa  330  7e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.62 
 
 
201 aa  266  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  64.58 
 
 
201 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  66.15 
 
 
197 aa  265  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.1 
 
 
201 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  63.96 
 
 
197 aa  265  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  65.31 
 
 
201 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  65.62 
 
 
197 aa  265  3e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  65.1 
 
 
201 aa  264  6e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.06943e-07  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  65.1 
 
 
201 aa  264  6e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  64.58 
 
 
201 aa  264  6e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  65.1 
 
 
201 aa  264  6e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.38757e-05  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.1 
 
 
197 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.1 
 
 
201 aa  263  9e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.1 
 
 
201 aa  263  9e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  65.1 
 
 
201 aa  263  9e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  65.62 
 
 
201 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.21511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  61.22 
 
 
200 aa  246  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  46.67 
 
 
200 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.91679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  47.62 
 
 
204 aa  171  8e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  45.6 
 
 
195 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.16 
 
 
196 aa  147  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  45.7 
 
 
196 aa  147  1e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  41.86 
 
 
205 aa  140  2e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  42.77 
 
 
196 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.2 
 
 
204 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.2 
 
 
204 aa  126  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  32.8 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  29.29 
 
 
208 aa  82  6e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  31.4 
 
 
207 aa  81.6  6e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  31.4 
 
 
207 aa  80.9  1e-14  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  75.5  4e-13  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  28.04 
 
 
210 aa  73.6  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  27.37 
 
 
199 aa  73.2  2e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.29 
 
 
207 aa  72.8  3e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  29.95 
 
 
202 aa  70.9  1e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  27.75 
 
 
197 aa  70.5  2e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  30.89 
 
 
195 aa  69.3  4e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1306  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123286  hitchhiker  1.11415e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1978  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2162  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41487e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1321  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  hitchhiker  3.88777e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1283  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1620  fibronectin-binding protein B  26.43 
 
 
216 aa  63.5  2e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0791942  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1635  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.73 
 
 
197 aa  62  5e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00120258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1227  putative lipoprotein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.00273e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01101  predicted outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01109  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1228  putative lipoprotein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0969231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1485  putative lipoprotein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.757345  hitchhiker  7.42206e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2496  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60622e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2218  putative lipoprotein  27.86 
 
 
212 aa  61.6  7e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2021  putative lipoprotein  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351626  hitchhiker  7.02236e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2542  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.57 
 
 
213 aa  61.6  7e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00786128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  26.42 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1604  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.6 
 
 
197 aa  58.5  5e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1698  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.84 
 
 
191 aa  57.4  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2816  putative lipoprotein  24.84 
 
 
191 aa  57  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1590  putative lipoprotein  24.84 
 
 
191 aa  57  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.99 
 
 
199 aa  56.2  3e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0427  hypothetical protein  27.68 
 
 
177 aa  54.7  9e-07  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2490  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.41 
 
 
193 aa  53.1  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2796  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.57 
 
 
193 aa  53.9  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1922  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.89 
 
 
195 aa  51.2  9e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939521  hitchhiker  4.34188e-06 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  23.15 
 
 
209 aa  50.4  2e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  22.84 
 
 
211 aa  48.5  5e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>