More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003967 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 268 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  92.91 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  82.46 
 
 		 268 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  82.46 
 
 		 268 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  79.03 
 
 		 268 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  76.49 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  75.37 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  76.03 
 
 		 268 aa  447  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  74.25 
 
 		 269 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  73.13 
 
 		 270 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  74.25 
 
 		 269 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  72.39 
 
 		 270 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  71.64 
 
 		 270 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  72.39 
 
 		 269 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  72.76 
 
 		 270 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  74.16 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  70.9 
 
 		 269 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  68.91 
 
 		 268 aa  407  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  66.67 
 
 		 272 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  66.29 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  63.67 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  63.06 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  65.79 
 
 		 270 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  62.31 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  62.31 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  65.41 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  62.31 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  63.06 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  62.31 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  63.06 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  62.31 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  62.31 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.906333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  63.06 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  62.31 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  61.94 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  63.67 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  65.04 
 
 		 270 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  65.41 
 
 		 270 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  66.42 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  63.2 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  63.91 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  64.66 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  64.31 
 
 		 289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  62.41 
 
 		 270 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  62.03 
 
 		 270 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  62.69 
 
 		 267 aa  359  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  61.65 
 
 		 270 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  61.65 
 
 		 270 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  59.4 
 
 		 270 aa  347  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  58.46 
 
 		 273 aa  339  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169666  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  60.97 
 
 		 271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000275406  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  58.89 
 
 		 272 aa  334  7e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  56.18 
 
 		 276 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  57.14 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  58.96 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  58.96 
 
 		 274 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  55.39 
 
 		 270 aa  324  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  55.26 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  38.81 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  39.33 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  38.52 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  40.3 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.45 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.8 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  38.49 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  38.02 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  38.66 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.1 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.58 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  39.43 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  37.12 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  36.7 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  35.45 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  37.36 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  36.98 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  35.21 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  37.88 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  35.74 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>