207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003928 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  100 
 
 
245 aa  506  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  97.96 
 
 
245 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  89.39 
 
 
246 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  83.82 
 
 
242 aa  427  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  74.17 
 
 
247 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  72.69 
 
 
267 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  71.37 
 
 
247 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  72.69 
 
 
267 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  71.37 
 
 
247 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  72.69 
 
 
267 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  71.37 
 
 
247 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  70.95 
 
 
247 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  70.95 
 
 
247 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  70.54 
 
 
246 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  71.67 
 
 
261 aa  367  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  70.12 
 
 
247 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  70.12 
 
 
247 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  72.2 
 
 
247 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  71.67 
 
 
247 aa  363  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  359  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  69.58 
 
 
241 aa  352  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  63.49 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  62.66 
 
 
243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  62.66 
 
 
243 aa  322  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  63.9 
 
 
243 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  64.29 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  64.29 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  64.29 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  64.29 
 
 
243 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  64.32 
 
 
243 aa  318  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  62.24 
 
 
252 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  62.24 
 
 
243 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  61 
 
 
243 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  61.83 
 
 
243 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  61.83 
 
 
243 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  59.75 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  62.76 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  60.82 
 
 
244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  60.58 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  61.09 
 
 
270 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  59.92 
 
 
244 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  57.44 
 
 
243 aa  298  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  56.79 
 
 
268 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  56.79 
 
 
247 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  57.44 
 
 
247 aa  293  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  56.79 
 
 
247 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  61.34 
 
 
243 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  57.14 
 
 
245 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  55.33 
 
 
247 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  55.97 
 
 
247 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  55.79 
 
 
247 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  58.58 
 
 
267 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  55.51 
 
 
247 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  54.92 
 
 
246 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  54.51 
 
 
252 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  55.6 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  55.04 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  55.46 
 
 
251 aa  278  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  50.2 
 
 
270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  53.98 
 
 
250 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  45.34 
 
 
262 aa  224  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  44.94 
 
 
262 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  44 
 
 
274 aa  221  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  44.94 
 
 
258 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  41.42 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  37.66 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  36.97 
 
 
234 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  38.49 
 
 
249 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  36.13 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  37.39 
 
 
235 aa  156  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  35.56 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  35.98 
 
 
234 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  38.22 
 
 
235 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  38.22 
 
 
235 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  38.67 
 
 
235 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  36.13 
 
 
234 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.03 
 
 
234 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  34.84 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  34.22 
 
 
253 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  32.3 
 
 
228 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 
242 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  22.5 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26.02 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  35.85 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  21.82 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
1287 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  27.06 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  28.39 
 
 
246 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.05 
 
 
252 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>