245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003803 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  100 
 
 		 476 aa  919    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  94.74 
 
 		 456 aa  845    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  62.41 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  50.33 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  43.93 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.17 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  47.25 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  42.54 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  41.89 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  42.26 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  44.47 
 
 		 449 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  41.89 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  44.91 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  41.91 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  43.44 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  40.41 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  44.98 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.63 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  41.26 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  40.41 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  40.63 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.5 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  40.6 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.64 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  39.95 
 
 		 446 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  39.95 
 
 		 446 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.41 
 
 		 446 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  40.41 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  40.72 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  39.41 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 		 450 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  40.86 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  39.65 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  40.39 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  42.47 
 
 		 486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  42.22 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  40.31 
 
 		 452 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  40.68 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  38.33 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  41.11 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  41.61 
 
 		 453 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  39.02 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  42.76 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  35.76 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  37.64 
 
 		 454 aa  289  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  39.06 
 
 		 486 aa  289  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  38.64 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  38.64 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  41.09 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  38.67 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  38.67 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  38.85 
 
 		 460 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  36.47 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  41.7 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  38.14 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  38.44 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  42.53 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  39.59 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  40.5 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  40.5 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  39.37 
 
 		 445 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  40.5 
 
 		 452 aa  279  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  39.14 
 
 		 445 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  35.15 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.37 
 
 		 445 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.91 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  40.05 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  40.05 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  40.05 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  38.91 
 
 		 445 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  40.05 
 
 		 452 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  38.69 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.55 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  38.65 
 
 		 461 aa  276  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  38.63 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  39.55 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  36.19 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  37.55 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  38.39 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  38.74 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  40.5 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  40.5 
 
 		 452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  37.12 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  40.05 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  39.12 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  39.12 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  39.04 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.4 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  36.5 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.62 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  38.34 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  38.69 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  35.27 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>