More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003772 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  85.31 
 
 		 458 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  70.83 
 
 		 458 aa  634    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 458 aa  908    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  63.88 
 
 		 459 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  33.18 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  38.03 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  32.59 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  33.72 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 461 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  26.4 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  25.16 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25.58 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  26.76 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  23.83 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  23.83 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  23.83 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  23.64 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.94 
 
 		 464 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 475 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 458 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  20.22 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 466 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  23.54 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.84 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  21.04 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.75 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  21.09 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  23.63 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.57 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.55 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  23.13 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  23.21 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  24.17 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  25.13 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.23 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>